Les affections psychosomatiques au sens classique sont extra-cérébrales. Néanmoins, il n'y a pas de raison pour que les circuits du cerveau ne puissent être affectés par un processus psychosomatique. La théorie de la neuroplasticité permet de rendre compte des modifications cérébrales et d'expliquer comment les maladies mentales sont des maladies psychosomatiques, ce qui les différencie des maladies neurologiques, en dépit du faux positivisme ambiant.