La guerre commença lorsque des légions de créatures monstrueuses connues sous le nom de kaijus sortirent de l'océan. Au cours des années qui suivirent, elle fit des millions de victimes et engloutit toutes les ressources de la planète. Une nouvelle arme fut conçue afin de vaincre les monstres géants : les Jaegers, d'immenses robots contrôlés par deux pilotes. Mais même eux se révélèrent impuissants à entraver l'avancée des kaijus...

Alors que tout semble perdu, les défenseurs de l'humanité n'ont d'autre choix que de faire confance à deux héros improbables : Raleigh Becket, ancien pilote, et Mako Mori, nouvelle recrue tout juste formée. Ensemble, ils reprendront les commandes d'un Jaeger légendaire mais aujourd'hui dépassé. Ils représentent la dernière chance de l'humanité d'échapper à une apocalypse imminente.